Manfred BRANDSTETTER fit ses études musicales à Stuttgart ; il fut organiste et maître de chapelle du district de Kirchheim/Teck.
En 1960, il est organiste et maître de chapelle à Lübeck (ville du Nord de l’Allemagne) où il est également professeur à l’École d’orgue.

En 1964, Manfred BRANDSTETTER vient à Berlin où il est organiste de l’Église Saint-Matthäus, et professeur au Conservatoire.

Depuis 1967, il est organiste et maître de chapelle de la Cathédrale Marktkirche d’Hanovre, et responsable de nombreux concerts de musique religieuse à Hanovre, où il enseigne également l’orgue à l’Académie d’État de musique et Théâtre. De nombreux voyages l’ont conduit à donner des récitals en Allemagne et à l’étranger, où il a également effectué des enregistrements radiophoniques.