Yeon-ju KIM est née à Séoul en Corée de Sud où elle commence très tôt ses études musicales par le piano. En 2002, elle entre à l’Université de Yonsei dans la classe de Madame Kwak, organiste titulaire du très célèbre orgue de Torch Center.
Par ailleurs, elle poursuit ses études au CNR de Saint-Maur des Fossés dont elle obtient un Premier Prix d’orgue et de clavecin dans les classes d’Éric Lebrun et de Richard Siegel. En 2007, elle est admise dans la classe d’orgue de Michel Bouvard et d’Olivier Latry au Conservatoire National Supérieur de Musique et de Danse de Paris.
Yeon-ju Kim s’est déjà fait remarquer lors de concours internationaux en remportant notamment le Grand Prix de Bethesda. Elle a également donné de nombreux récitals et elle a participé à plusieurs académies internationales d’orgue.